Expertos piden un sistema global de alerta genética para combatir la próxima pandemia y la resistencia a los antimicrobianos

Notas de los editores

La pandemia de COVID-19 puso al mundo patas arriba. Para combatirlo, una de nuestras armas más importantes fue la vigilancia genómica, basada en la secuenciación del genoma completo, que recopila todos los datos genéticos de un microorganismo determinado. Esta poderosa tecnología rastreó la propagación y evolución del virus, ayudando a guiar las respuestas de salud pública y el desarrollo de vacunas y tratamientos.

Pero la vigilancia genómica podría hacer mucho más para reducir el número de enfermedades y muertes en todo el mundo que simplemente protegernos del COVID-19. Escribiendo en Fronteras en la cienciaun colectivo internacional de microbiólogos clínicos y de salud pública de la Sociedad Europea de Microbiología Clínica y Enfermedades Infecciosas (ESCMID) pide inversión en tecnología, capacidad, experiencia y colaboración para poner la vigilancia genómica de patógenos a la vanguardia de la preparación para futuras pandemias.

«Las enfermedades infecciosas propensas a epidemias cruzan fronteras tan rápido como las personas y los bienes comerciales viajan por el mundo», dijo el autor principal, el profesor Marc Struelens de la Universidad libre de Bruselas, Bélgica, y ex microbiólogo jefe del Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. (ECDC). «Un brote local hoy puede convertirse mañana en la próxima crisis pandémica mundial».

Una ventaja vital

La mayoría de las enfermedades nunca antes vistas en humanos son zoonosis: enfermedades encontradas en animales que infectan a los humanos. Muchas enfermedades de los animales también se tratan con antibióticos y otros antimicrobianos que se utilizan en humanos. Sin embargo, el uso generalizado de antimicrobianos en humanos y animales ha generado resistencia, a medida que los microbios evolucionan para sobrevivir. Así pues, nos enfrentamos a dos importantes amenazas a la salud pública que se superponen: una de nuevas enfermedades infecciosas que son zoonosis, y otro por la creciente resistencia a los antimicrobianos. Abordar estas amenazas requiere un enfoque colaborativo de Una Salud, defendido por la Organización Mundial de la Salud (OMS), que reconozca que la salud humana depende de la salud de nuestro ecosistema.

La respuesta, dicen los científicos, es reutilizar la mayor tecnología y capacidad de vigilancia genómica aportada por la COVID-19 para que actúen como centinelas. Es necesario utilizar una vigilancia genómica que reúna a agencias de salud pública, veterinarios y médicos para monitorear las enfermedades humanas y animales y la resistencia a los antimicrobianos. Integrando los aspectos epidemiológicos y Datos clinicos De todos estos campos podemos obtener una imagen completa de los patógenos y los riesgos que plantean.

«La vigilancia genómica de patógenos es una herramienta que analiza la interacción entre la presión selectiva de los antimicrobianos sobre poblaciones de microbios y la evolución adaptativa de esos microbios hacia la resistencia a los medicamentos», dijo Struelens. «Nos permite detectar la aparición y desentrañar la dinámica de transmisión de clones epidémicos súper aptos y resistentes a múltiples fármacos: las ‘superbacterias’. La vigilancia genómica puede ayudar a rastrear la transmisión zoonótica e interhumana de variantes virales, cepas de bacterias y signos de resistencia a los medicamentos».

Respuesta rápida

La vigilancia genómica de patógenos en tiempo real puede permitirnos detectar rápidamente nuevas cepas de bacterias resistentes y nuevas enfermedades que saltan entre humanos y animales, y monitorear su propagación y evolución.

Esta información puede servir de base para las campañas de vacunación, ayudar a diseñar tratamientos específicos y orientar las respuestas de salud pública, todo lo cual podría ayudar a evitar que estallen epidemias.

La monitorización de genomas completos también nos permitiría estudiar nuevas enfermedades y la evolución de enfermedades conocidas con mayor profundidad, evaluar su peligrosidad e identificar contramedidas. En un mundo globalizado, donde los patógenos viajan rápidamente, la vigilancia genómica permitiría diagnosticar y tratar infecciones con la misma rapidez.

Struelens y sus colegas destacan cómo las nuevas tecnologías de secuenciación, incluida la secuenciación genómica de lectura larga, la secuenciación ultrarrápida y la secuenciación unicelular, así como la inteligencia artificial, están ayudando a impulsar el progreso en la vigilancia en algunas partes del mundo.

«Hay muchos lugares donde la vigilancia genómica ya está proporcionando una protección crucial contra la propagación de enfermedades», afirmó Struelens. «Esto incluye infecciones transmitidas por alimentos en Europa, América del Norte y Australia, y enfermedades virales epidémicas como la influenza aviar en muchos países del mundo».

Un mundo conectado

Para que la vigilancia genómica sea eficaz, dicen los científicos, necesitamos datos mundiales, accesibles y en tiempo real. Para lograrlo, necesitamos una inversión masiva en capacidad y experiencia que tenga en cuenta los diferentes niveles de infraestructura y capacitación disponibles en todo el mundo. Durante la pandemia de COVID-19, los países que ya tenían acceso a conocimientos y equipos de vigilancia genómica tuvieron una gran ventaja para monitorear la pandemia y adaptar su respuesta. Los autores proporcionan un marco para la implementación equitativa de sistemas globalmente interconectados. sistemas de vigilancia que incluyen países de ingresos bajos y medios.

«El artículo de Struelens et al. es una lectura obligada para cualquier persona interesada en la vigilancia genómica como parte de la preparación para epidemias», afirmó la profesora Marion Koopmans del Centro Médico Erasmus de Rotterdam, Países Bajos, en un editorial adjunto. «Las herramientas y la ambición están ahí; el próximo paso es construir infraestructuras de vigilancia colaborativas y equitativas para la salud global futura. El ‘Tratado contra Pandemias’ propuesto por la OMS será clave, ya que definirá algunas de las reglas del compromiso internacional para una mejor preparación. Se avecinan tiempos interesantes. «.

También necesitamos invertir urgentemente en colaboración, tender puentes entre disciplinas de salud animal, salud humana y pública, y servir de enlace entre los países y las agencias de salud. Esto será fundamental para garantizar no sólo que las partes interesadas puedan trabajar juntas, sino que lleguemos a acuerdos sobre la gestión y regulación de datos, de modo que los datos de los pacientes sean anónimos y estén protegidos.

«Para garantizar la participación universal en los sistemas colaborativos de vigilancia genómica en todo el mundo, nuestros desafíos críticos son suficiente capacidad de laboratorio y secuenciación, la capacitación de una fuerza laboral experta y el acceso a análisis de datos genómicos validados y herramientas para compartir dentro de una información de salud digital integral y segura. infraestructura», afirmó Struelens. «La integración de la información genómica de los patógenos epidémicos con la información epidemiológica debe realizarse a escala, desde el nivel local hasta el global».